MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Bacillus amyloliquefaciens IT-45 plasmid pBA45-1

Total Repeats: 61

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020273	CCA	2	6	24	29	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2	NC_020273	C	6	6	60	65	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
3	NC_020273	C	6	6	68	73	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4	NC_020273	CAAA	2	8	107	114	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_020273	GTTT	2	8	118	125	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020273	TGAG	2	8	152	159	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_020273	TCC	2	6	172	177	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_020273	TAC	2	6	394	399	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_020273	CTC	2	6	403	408	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_020273	ATTT	2	8	452	459	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_020273	AAAC	2	8	502	509	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
12	NC_020273	CAGT	2	8	527	534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_020273	AAC	2	6	605	610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_020273	ATA	2	6	617	622	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020273	TGC	2	6	1168	1173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_020273	AT	3	6	2644	2649	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_020273	TAC	2	6	2700	2705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_020273	CT	3	6	2759	2764	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_020273	AT	4	8	2882	2889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020273	A	6	6	2929	2934	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_020273	TCC	2	6	3533	3538	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_020273	CAAAAT	2	12	3573	3584	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_020273	A	6	6	3585	3590	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020273	ATA	2	6	4063	4068	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020273	CTTAA	2	10	4074	4083	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_020273	ATTA	2	8	4564	4571	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020273	AT	3	6	4575	4580	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020273	TAT	2	6	4608	4613	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020273	T	6	6	4629	4634	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020273	T	7	7	4668	4674	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020273	A	8	8	4711	4718	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020273	TAT	2	6	5801	5806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020273	TTTGG	2	10	5807	5816	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020273	ATA	2	6	5826	5831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020273	AC	3	6	5874	5879	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_020273	TAA	2	6	5887	5892	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_020273	ATG	2	6	5904	5909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020273	TTG	2	6	5910	5915	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020273	TA	3	6	5917	5922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_020273	A	6	6	5968	5973	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020273	T	7	7	5994	6000	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_020273	C	6	6	6030	6035	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
43	NC_020273	T	6	6	6047	6052	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_020273	A	7	7	6054	6060	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_020273	ATT	2	6	6079	6084	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_020273	CA	3	6	6119	6124	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_020273	ATT	2	6	6158	6163	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020273	A	6	6	6179	6184	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020273	CCG	2	6	6488	6493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
50	NC_020273	CAG	2	6	6516	6521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_020273	TTG	2	6	7722	7727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_020273	ATA	2	6	7754	7759	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020273	TAC	2	6	7781	7786	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_020273	ACA	2	6	7787	7792	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_020273	A	6	6	7805	7810	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_020273	TAC	2	6	7847	7852	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_020273	C	6	6	7852	7857	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58	NC_020273	AGG	2	6	7867	7872	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020273	CGGTC	2	10	7889	7898	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
60	NC_020273	TC	3	6	7942	7947	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_020273	T	6	6	7968	7973	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.